Surveillance de la résistance dans le bétail et dans la viande

La surveillance de la résistance chez les bactéries zoonotiques et indicatrices présentes chez les animaux d’élevage sains destinés à l’abattage a été harmonisée à l’échelle de l’Union européenne en 2014.

La résistance aux antibiotiques chez les bactéries commensales issues de la flore intestinale et de la viande fraîche d’animaux destinés à l’alimentation en bonne santé peut servir d’« indicateur » de facteurs tels que la pression sélective exercée par l’utilisation d’agents antibiotiques au sein de ces populations. Ces bactéries constituent un réservoir de gènes de résistance potentiellement transférables, susceptibles de se propager horizontalement à d’autres bactéries, y compris les bactéries zoonotiques. Compte tenu du risque de compromettre l’efficacité des traitements antibiotiques contre les infections chez l’homme, il est particulièrement important de surveiller la résistance aux antibiotiques chez les bactéries zoonotiques isolées chez les animaux.

La surveillance de la résistance aux antibiotiques chez ces bactéries fournit des informations sur les types de résistance présents dans les bactéries intestinales et la viande fraîche des animaux destinés à l’alimentation. Ces informations peuvent alors s’avérer pertinentes pour l’étude de la résistance aux antibiotiques chez les bactéries présentes chez l’homme. Par conséquent, cette surveillance est pertinente tant pour la santé publique que pour la santé animale. Elle constitue également un précieux système d’alerte précoce permettant d’identifier les types de résistance émergents au sein des populations de bétail et de surveiller leur propagation potentielle.

Avec l’émergence, au cours des dernières décennies, de bactéries multirésistantes en médecine humaine et vétérinaire, la surveillance a été étendue aux E. coli productrices de BLSE/AmpC et de carbapénémases et, depuis 2020, aux Klebsiella spp. productrices de carbapénémases. En raison de son importance en médecine humaine, le Staphylococcus aureus résistant à la méticilline (SARM), une bactérie commensale que l’on peut trouver dans les tissus mous d’animaux en bonne santé, est inclus dans la surveillance de la résistance aux antibiotiques chez les porcs et les veaux.

Animaux

Bovin

Bovin

Suivi de la résistance chez les bovins

Les graphiques suivants résument les profils de résistance des échantillons prélevés dans les abattoirs (indicateur de la résistance au sein des troupeaux suisses) et dans le commerce de détail (indicateur de la contamination de la viande fraîche). Les données recueillies depuis 2006 dressent un bilan contrasté : la résistance a considérablement augmenté pour certaines bactéries, mais est restée stable ou a diminué pour d’autres.

Comment utiliser le graphique interactif

Sélectionnez l'agent pathogène qui vous intéresse dans les menus déroulants. Utilisez les cases à cocher pour activer ou désactiver les classes d'antibiotiques, les intervalles de confiance et les types de graphiques (pourcentage ou nombres absolus). Lorsque vous passez la souris sur le graphique, une barre d'outils s'affiche, vous permettant de zoomer ou d'afficher les données au survol.

Abréviations

IC à 95 % : intervalle de confiance à 95 %

Structure et traitement des données

Pour cette analyse, tous les isolats testés face à l'agent pathogène correspondant ont été pris en compte. Les résultats sont présentés tels qu'ils ont été fournis par le Centre pour les zoonoses, les maladies bactériennes animales et la résistance aux antimicrobiens (ZOBA).

Ces données sont fournies à des fins de surveillance et ne sont pas destinées à être utilisées uniquement pour prendre des décisions thérapeutiques.

Informations supplémentaires

Micro-organismes multirésistants (bovins)

Comment utiliser le graphique interactif

Utilisez les cases à cocher pour activer ou désactiver les agents pathogènes, l'origine des échantillons et les intervalles de confiance. Lorsque vous passez la souris sur le graphique, une barre d'outils s'affiche, vous permettant de zoomer ou d'afficher les données au survol.

Abréviations

IC à 95 % : intervalle de confiance à 95 %

Structure et traitement des données

Pour cette analyse, tous les isolats testés face à l'agent pathogène correspondant ont été pris en compte. Les résultats sont présentés tels qu'ils ont été fournis par le Centre pour les zoonoses, les maladies bactériennes animales et la résistance aux antimicrobiens (ZOBA).

Ces données sont fournies à des fins de surveillance et ne sont pas destinées à être utilisées uniquement pour prendre des décisions thérapeutiques.

Informations supplémentaires
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Porc

Porc

Suivi de la résistance chez les porcs

Les graphiques suivants résument les profils de résistance des échantillons prélevés dans les abattoirs (indicateur de la résistance au sein des troupeaux suisses) et dans le commerce de détail (indicateur de la contamination de la viande fraîche). Les données recueillies depuis 2006 présentent un tableau contrasté : la résistance a considérablement augmenté pour certaines bactéries, mais est restée stable ou a diminué pour d’autres.

Comment utiliser le graphique interactif

Sélectionnez l'agent pathogène qui vous intéresse dans les menus déroulants. Utilisez les cases à cocher pour activer ou désactiver les classes d'antibiotiques, les intervalles de confiance et les types de graphiques (pourcentage ou chiffres absolus). Lorsque vous passez la souris sur le graphique, une barre d'outils s'affiche, vous permettant de zoomer ou d'afficher les données au survol.

Abréviations

IC à 95 % : intervalle de confiance à 95 %

Structure et traitement des données

Pour cette analyse, tous les isolats ayant fait l'objet d'un test de sensibilité face à l'agent pathogène correspondant ont été pris en compte. Les résultats sont présentés tels qu'ils ont été fournis par le Centre pour les zoonoses, les maladies bactériennes animales et la résistance aux antimicrobiens (ZOBA).

Ces données sont fournies à des fins de surveillance et ne sont pas destinées à être utilisées uniquement pour prendre des décisions thérapeutiques.

Informations supplémentaires

Micro-organismes multirésistants (porcs)

Comment utiliser le graphique interactif

Utilisez les cases à cocher pour activer ou désactiver les agents pathogènes, l'origine des échantillons et les intervalles de confiance. Lorsque vous passez la souris sur le graphique, une barre d'outils s'affiche, vous permettant de zoomer ou d'afficher les données au survol.

Abréviations

IC à 95 % : intervalle de confiance à 95 %

Structure et traitement des données

Pour cette analyse, tous les isolats testés face à l'agent pathogène correspondant ont été pris en compte. Les résultats sont présentés tels qu'ils ont été fournis par le Centre pour les zoonoses, les maladies bactériennes animales et la résistance aux antimicrobiens (ZOBA).

Ces données sont fournies à des fins de surveillance et ne sont pas destinées à être utilisées uniquement pour prendre des décisions thérapeutiques.

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Poulet

Poulet

Suivi de la résistance chez les poulets

Les graphiques suivants résument les profils de résistance des échantillons prélevés dans les abattoirs (indicateur de la résistance au sein des troupeaux suisses) et dans le commerce de détail (indicateur de la contamination de la viande fraîche). Les données recueillies depuis 2006 dressent un tableau contrasté : la résistance a considérablement augmenté pour certaines bactéries, mais est restée stable ou a diminué pour d’autres.

Comment utiliser le graphique interactif

Sélectionnez l'agent pathogène qui vous intéresse dans les menus déroulants. Utilisez les cases à cocher pour activer ou désactiver les classes d'antibiotiques, les intervalles de confiance et les types de graphiques (pourcentage ou chiffres absolus). Lorsque vous passez la souris sur le graphique, une barre d'outils s'affiche, vous permettant de zoomer ou d'afficher les données au survol.

Abréviations

IC à 95 % : intervalle de confiance à 95 %

Structure et traitement des données

Pour cette analyse, tous les isolats ayant fait l'objet d'un test de sensibilité face à l'agent pathogène correspondant ont été pris en compte. Les résultats sont présentés tels qu'ils ont été fournis par le Centre pour les zoonoses, les maladies bactériennes animales et la résistance aux antimicrobiens (ZOBA).

Ces données sont fournies à des fins de surveillance et ne sont pas destinées à être utilisées uniquement pour prendre des décisions thérapeutiques.

Informations supplémentaires

Micro-organismes multirésistants (poulet)

Comment utiliser le graphique interactif

Utilisez les cases à cocher pour activer ou désactiver les agents pathogènes, l'origine des échantillons et les intervalles de confiance. Lorsque vous passez la souris sur le graphique, une barre d'outils s'affiche, vous permettant de zoomer ou d'afficher les données au survol.

Abréviations

IC à 95 % : intervalle de confiance à 95 %

Structure et traitement des données

Pour cette analyse, tous les isolats ayant fait l'objet d'un test de sensibilité face à l'agent pathogène correspondant ont été pris en compte. Les résultats sont présentés tels qu'ils ont été fournis par le Centre pour les zoonoses, les maladies bactériennes animales et la résistance aux antimicrobiens (ZOBA).

Ces données sont fournies à des fins de surveillance et ne sont pas destinées à être utilisées uniquement pour prendre des décisions thérapeutiques.

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Surveillance de la résistance chez les animaux malades

Suivi de la résistance chez les animaux malades

La surveillance de la résistance aux antibiotiques chez les agents pathogènes pertinents isolés chez les animaux d’élevage et de compagnie malades revêt une grande importance pour les vétérinaires. Elle leur permet de faire des choix appropriés en matière de traitements antibiotiques, qu’ils ne peuvent souvent pas fonder sur un antibiogramme avant le premier traitement. De plus, ces données comblent une autre lacune importante concernant la surveillance de la résistance aux antibiotiques dans une perspective « One Health ».

En 2019, une surveillance annuelle de la résistance aux antibiotiques chez les agents pathogènes vétérinaires a été lancée par l’Office fédéral de la sécurité alimentaire et des affaires vétérinaires (OSAV) et mise en œuvre au laboratoire national de référence suisse pour la résistance aux antimicrobiens (ZOBA). Le plan d’échantillonnage a été consolidé en 2022 afin d’inclure les combinaisons « agent pathogène/animal » et « indication » pertinentes en médecine vétérinaire.

Comment utiliser le graphique interactif

Sélectionnez une espèce animale, un agent pathogène et un type d'échantillon dans les menus déroulants. Utilisez les cases à cocher pour activer ou désactiver les séries chronologiques et les intervalles de confiance. Lorsque vous passez la souris sur le graphique, une barre d'outils s'affiche, vous permettant de zoomer ou d'afficher les données au survol.

Abréviations

IC à 95 % : intervalle de confiance à 95 %

Structure et traitement des données

Pour cette analyse, tous les isolats testés face à l'agent pathogène correspondant et transmis par les laboratoires ont été pris en compte. Les résultats sont fournis par des universités ainsi que par des laboratoires de diagnostic vétérinaire cantonaux et privés en Suisse. Les données présentées doivent être interprétées avec prudence, car pour certains agents pathogènes et certaines espèces, le nombre d’isolats reste faible. Ces données sont fournies à des fins de surveillance et ne sont pas destinées à être utilisées uniquement pour prendre des décisions thérapeutiques.

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Base de données interactive

Ce site web présente des données agrégées sur la résistance aux antibiotiques chez les animaux malades en Suisse. Ces données sont mises à jour chaque année.

Remarques

Disclaimer

Ces données doivent être interprétées avec prudence et ne doivent pas être utilisées comme des recommandations thérapeutiques, car le risque de résistance dépend des caractéristiques individuelles de chaque patient·e. Le choix du traitement doit se fonder non seulement sur les pourcentages de résistance, mais également sur d’autres facteurs tels que les effets indésirables, la toxicité, la biodisponibilité et la pression sélective. Pour certaines combinaisons micro-organisme/antibiotique, une augmentation des posologies ou l'introduction d'un traitement combiné peuvent s’avérer nécessaires.

Ces données peuvent être utilisées dans des présentations ou des publications à condition d’être correctement citées comme provenant du « Centre suisse pour le contrôle de l’Antibiorésistance, www.anresis.ch, consulté le [date] ».

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Notes

Résultats: Pourcentage (%) des isolats testés, n correspondant au nombre d’isolats testés.

Critères de sélection: Les données peuvent être stratifiées selon

  • Année
  • Espèce animale
  • Organe
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Guide ANRESIS : une carte interactive des données sur la résistance chez les pathogènes animaux

Le guide ANRESIS

Cet outil en ligne permet d'accéder rapidement et de manière intuitive aux dernières données sur la résistance aux antibiotiques chez les pathogènes animaux en Suisse, offrant ainsi aux professionnels du secteur vétérinaire des options thérapeutiques empiriques fiables.

 

Lien vers guide.anresis.ch

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