Données de résistance Médecine humaine
Les tendances des résistances varient selon les combinaisons microorganisme-antibiotique. Alors que les taux de résistance diminuent pour la méthicilline chez les Staphylococcus aureus et pour la pénicilline chez Streptococcus pneumoniae, des tendances à la hausse ont été observées pour les quinolones et les céphalosporines de troisième/quatrième génération chez les entérobactéries (par exemple E. coli et K. pneumoniae). Toutefois, ces tendances à la hausse se sont stabilisées au cours des dernières années. Comme le montre clairement le graphique animé ci-dessous, l’augmentation des taux de résistance se traduit également par une augmentation du fardeau de la maladie.
Déclarations mensuelles d’une sélection de microorganismes multirésistants en Suisse
Déclarations mensuelles d’une sélection de microorganismes multirésistants en Suisse
Choisissez la région souhaitée ou l’unité dans le menu déroulant. Pour activer/désactiver les séries temporelles ou des intervalles de confiance, cliquez sur les cases à cocher. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
ESCR-E.coli: Escherichia coli résistants aux céphalosporines à spectre étendu
ESCR-K.pneumoniae: Klebsiella pneumoniae résistants aux céphalosporines à spectre étendu
FQR-E.coli: Escherichia coli résistants aux fluoroquinolones
MRSA: Staphylococcus aureus résistants à la méticilline
PNSP: Streptococcus pneumoniae non sensibles à la pénicilline
VRE: Enterococcus faecium résistants à la vancomycine
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Seuls les isolats invasifs de sang et de fluide cérébrospinal qui ont été testés contre les antibiotiques correspondants (catégories) ont été utilisés pour cette analyse. Si plusieurs antibiotiques étaient testés dans la même catégorie, le résultat le plus résistant était pris en compte. Seul le premier isolat par patient, micro-organisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants évolue avec le temps, ce qui peut également affecter les statistiques. Ces données de résistance sont présentées pour la surveillance épidémiologique et ne doivent pas être interprétées comme une recommandation thérapeutique en soi.
Fardeau de la résistance aux antibiotiques en Suisse
Estimation du nombre d’infections, des années de vie corrigées de l’incapacité (angl. disability-adjusted life-years, DALY) et des décès attribuables causés par une sélection de 16 bactéries résistantes aux antibiotiques en Suisse 2010-2021. Les tailles des cercles sont proportionnelles au nombre de DALY. Une étude sur le fardeau de la résistance aux antibiotiques en Suisse a été publié dans Eurosurveillance en 2023.
Fardeau de la résistance aux antibiotiques en Suisse
Estimation du nombre d’infections, des années de vie corrigées de l’incapacité (angl. disability-adjusted life-years, DALY) et des décès attribuables causés par une sélection de 16 bactéries résistantes aux antibiotiques en Suisse 2010-2021. Les tailles des cercles sont proportionnelles au nombre de DALY. Une étude sur le fardeau de la résistance aux antibiotiques en Suisse a été publié dans Eurosurveillance en 2023.
Déplacez la souris sur le graphique afin d’afficher les données au survol. Zoomez pour visualiser des petits cercles.
DALY : années de vie corrigées de l’incapacité (angl. disability-adjusted life-years)
ColRACI : Acinetobacter spp. résistant à la colistine.
CRACI : Acinetobacter spp. résistant aux carbapénèmes.
MDRACI : Acinetobacter spp. multirésistante.
VRE : Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium résistants à la vancomycine.
ColREC : Escherichia coli résistant à la colistine.
CREC : E coli résistant aux carbapénèmes.
3GCREC : E coli résistant aux céphalosporines de troisième génération.
ColRKP : Klebsiella pneumoniae résistant à la colistine.
CRKP : K pneumoniae résistant aux carbapénèmes.
3GCRKP : K pneumoniae résistant aux céphalosporines de troisième génération.
ColRPA : Pseudomonas aeruginosa résistant à la colistine.
CRPA : P aeruginosa résistant aux carbapénèmes.
MDRPA : P aeruginosa multirésistant.
MRSA : Staphylococcus aureus résistant à la méticilline.
PRSP : Streptococcus pneumoniae résistant à la pénicilline.
PMRSP : S pneumoniae résistant à la pénicilline et aux macrolides.
La méthodologie de Cassini et al. 2018 (1) a été adapté pour estimer les différents paramètres (infections, DALY, décès). Pour ces calculs les données sur les bactériémies stratifiées au niveau régional de la base de données ANRESIS ont été utilisées. Comme Cassini et al., nous avons aussi utilisé le « Burden of Communicable Disease in Europe Toolkit » sur la base de 10’000 simulations de Monte Carlo. Remarque importante : la méthodologie utilisée pour le graphique présenté ici diffère légèrement de celle utilisée pour les estimations présentées dans Eurosurveillance (2). C’est-à-dire, l’approche présentée ici exclut des estimations les isolats considérés comme intermédiaires (« susceptible with increased exposure »). Les estimations présentées ici sont donc légèrement inférieures.
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Microorganismes
Acinetobacter spp.
Acinetobacter spp.
Situation de résistance stable chez ce germe déjà intrinsèquement résistant contre de nombreux antibiotiques.
Les infections à Acinetobacter spp. surviennent surtout en milieu hospitalier, chez des personnes déjà affaiblies et hospitalisées en unités de soins intensifs. Elles conduisent à des infections du tractus respiratoire, urinaire et des infections de plaie, mais aussi à des septicémies et des méningites. Depuis 10 ans, la situation de leur résistance est stable en Suisse. Au contraire d’autres pays européens, nous n’observons pas d’augmentation de résistance aux carbapénèmes.
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Links / Littérature:
Prevalence of carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii from 2005 to 2016 in Switzerland.
Aspergillus spp.
Aspergillus spp.
Les Aspergillus sont omniprésents dans la nature et provoquent un large éventail de maladies chez l’homme.
Les espèces d’Aspergillus peuvent provoquer une aspergillose invasive potentiellement mortelle chez les hôtes immunodéprimés. Les infections sont le plus souvent causées par Aspergillus fumigatus. Néanmoins, des espèces d’Aspergillus non fumigatus sont de plus en plus souvent signalées. En outre, la résistance aux azoles de A. fumigatus est apparue dans le monde entier et a été associée à un taux de mortalité élevé chez les hôtes immunodéprimés.
Choisissez un microorganisme souhaitée dans le menu déroulant. Pour activer/désactiver les séries temporelles ou des intervalles de confiance, cliquez sur les cases à cocher. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données. La répartition des espèces peut être représentée en pourcentage ou en chiffres absolus (ces derniers peuvent augmenter au fil du temps, à mesure que le réseau ANRESIS s’étend).
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Tous les isolats qui ont été testés contre les (catégories d’) antimycosic correspondants ont été utilisés pour cette analyse. Si plusieurs antimycosic étaient testés dans la même catégorie, le résultat le plus résistant était pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Concernant le diagramme en barres empilées : lors de la déduplication, seule la combinaison antimycosic-microorganisme avec le N le plus élevé a été prise en compte ici. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Le nombre de laboratoires participants évolue avec le temps, ce qui peut également affecter les résultats. Ces données de résistance sont présentées pour la surveillance épidémiologique et ne doivent pas être interprétées comme une recommandation thérapeutique en soi.
Campylobacter spp.
Campylobacter spp.
Les Campylobacter sont généralement contractés par le biais d’aliments contaminés, en particulier la volaille insuffisamment cuite.
Les infections peuvent provoquer des diarrhées, mais peuvent aussi être asymptomatiques. Dans la plupart des cas, aucun traitement antibiotique n’est nécessaire. Les taux de résistance globale sont plus élevés chez C. coli que chez C. jejuni et pour les fluoroquinolones que pour les macrolides.
Choisissez un microorganisme souhaitée dans le menu déroulant. Pour activer/désactiver les séries temporelles ou des intervalles de confiance, cliquez sur les cases à cocher. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données. La répartition des espèces peut être représentée en pourcentage ou en chiffres absolus (ces derniers peuvent augmenter au fil du temps, à mesure que le réseau ANRESIS s’étend).
95% CI: 95% Intervalle de confiance de 95%
Tous les isolats qui ont été testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés pour cette analyse. Si plusieurs antibiotiques étaient testés dans la même catégorie, le résultat le plus résistant était pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Concernant le diagramme en barres empilées : lors de la déduplication, seule la combinaison antibiotique-microorganisme avec le N le plus élevé a été prise en compte ici. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Le nombre de laboratoires participants évolue avec le temps, ce qui peut également affecter les résultats. Ces données de résistance sont présentées pour la surveillance épidémiologique et ne doivent pas être interprétées comme une recommandation thérapeutique en soi.
Links / Littérature:
Candida spp.
Candida spp.
Les manifestations cliniques de l’infection par les espèces de Candida vont des infections locales des muqueuses à la candidémie et à la dissémination généralisée avec défaillance multisystémique des organes.
Candida albicans est toujours considéré comme le principal agent pathogène responsable, mais on observe dans le monde entier une évolution vers des espèces de Candida non albicans. La candidose est l’une des principales causes d’infections sanguines acquises en milieu hospitalier et représente l’une des infections fongiques invasives nosocomiales les plus répandues dans le monde. En outre, l’émergence d’espèces de Candida résistantes aux médicaments est une préoccupation majeure.
Choisissez un microorganisme souhaitée dans le menu déroulant. Pour activer/désactiver les séries temporelles ou des intervalles de confiance, cliquez sur les cases à cocher. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données. La répartition des espèces peut être représentée en pourcentage ou en chiffres absolus (ces derniers peuvent augmenter au fil du temps, à mesure que le réseau ANRESIS s’étend).
95% CI: 95% confidence interval
Tous les isolats qui ont été testés contre les (catégories d’) antimycosic correspondants ont été utilisés pour cette analyse. Si plusieurs antimycosic étaient testés dans la même catégorie, le résultat le plus résistant était pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Concernant le diagramme en barres empilées : lors de la déduplication, seule la combinaison antimycosic-microorganisme avec le N le plus élevé a été prise en compte ici. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Le nombre de laboratoires participants évolue avec le temps, ce qui peut également affecter les résultats. Ces données de résistance sont présentées pour la surveillance épidémiologique et ne doivent pas être interprétées comme une recommandation thérapeutique en soi.
Entérocoques
Entérocoques
Après plusieurs années stables, la résistance à la vancomycine chez les entérocoques est en augmentation depuis 2018.
Les entérocoques appartiennent à la flore intestinale et sont peu pathogènes, mais peuvent être à l’origine d’infections sévères surtout en milieu hospitalier. Jusqu’à maintenant la résistance à la vancomycine était stable, mais on a observé une augmentation des entérocoques résistants à la vancomycine en Suisse en 2018 notamment à cause d’une flambée du clone ST 796 (cf Littérature). Swissnoso a rédigé récemment des Recommandations d’experts à l’intention des établissements de soins pour lutter contre la propagation des entérocoques résistants à la vancomycine en Suisse, les données cantonales VRE sont mises à jour mensuellement (voir graphique tout en bas).
Enterococcus faecalis
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Enterococcus faecium
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Entérocoques résistants à la vancomycine (ERV) par canton
Les nouveaux cas de ERV semestriel et par canton. Seuls les patients hospitalisés sont considérés, les doubles (même patient) sont exclus. Dans le cas d’échantillons multiples par patient, l’échantillon le plus invasif est considéré. Les échantillons de dépistage sont définis en fonction du site de prélèvement « anal », « rectal », « peau intacte » ou « muqueuses ».
Entérocoques résistants à la vancomycine (ERV) par canton
Les nouveaux cas de ERV semestriel et par canton. Seuls les patients hospitalisés sont considérés, les doubles (même patient) sont exclus. Dans le cas d’échantillons multiples par patient, l’échantillon le plus invasif est considéré. Les échantillons de dépistage sont définis en fonction du site de prélèvement « anal », « rectal », « peau intacte » ou « muqueuses ».
Pour activer/désactiver un type d’échantillon, cliquez sur le symbole dans la légende. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
Année_1: Premier semestre de l’année, Année_2: Deuxième semestre de l’année
De chaque patient, l’isolat le plus invasif qui a été prélevé dans une année civile a été pris en compte. Le nombre de laboratoires participants évolue avec le temps, ce qui peut également affecter les résultats.
Links / Littérature:
Recommandations provisoires d’experts à l’intention des établissements de soins pour lutter contre la propagation des entérocoques résistants à la vancomycine (VRE) en Suisse.
Emergence of vancomycin-resistant enterococci in Switzerland: a nation-wide survey.
Emergence of vancomycin-resistant enterococci in Switzerland: a nation-wide survey.
Outbreak of vancomycin-resistant Enterococcus faecium clone ST796, Switzerland, December 2017 to April 2018.
Outbreak of vancomycin-resistant Enterococcus faecium clone ST796, Switzerland, December 2017 to April 2018
Euro Surveill. 2018 Jul;23(30)
Escherichia coli
Escherichia coli
La résistance aux quinolones et aux céphalosporines de troisième et quatrième génération n’a cessé d’augmenter depuis 2004, mais s’est stabilisée ces dernières années.
Les Escherichia coli appartiennent aux germes les plus fréquents, autant en ambulatoire que dans le milieu hospitalier. Ils colonisent la flore intestinale normale de l’Homme et conduisent par ex. à des infections urinaires, des pyélonéphrites et des septicémies.
La résistance aux quinolones a augmenté de 10.3% en 2004 à 19.4% en 2015, mais elle a diminué de manière significative au cours des quatre dernières années. La consommation de quinolones est une cause importante de l’augmentation des résistances aux quinolones chez E. coli . Les quinolones devraient alors être prescrites de façon exceptionnelle pour le traitement des infections urinaires non compliquées.
La résistance aux 3ème et 4ème génération a augmenté en continu de 0.9% en 2004 à 11% en 2018, mais se sont stabilisés depuis. L’augmentation a eu lieu en ambulatoire et en milieu hospitalier pratiquement en parallèle. Les E. coli résistant aux céphalosporines de 3ème et 4ème génération ont été identifiés dans différents environnements, comme par exemple aux retours de voyage, chez les animaux ou les eaux.
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Links / Littérature:
Temporal trends of extended-spectrum cephalosporin resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Switzerland.
Assessment of the Prevalence of Extended-Spectrum β-Lactamase-Producing Enterobacteriaceae in Ready-to-Eat Salads, Fresh-Cut Fruit, and Sprouts from the Swiss Market.
Characteristics of extended-spectrum β-lactamase- and carbapenemase-producing Enterobacteriaceae Isolates from rivers and lakes in Switzerland.
High colonization rates of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli in Swiss travellers to South Asia- a prospective observational multicentre cohort study looking at epidemiology, microbiology and risk factors.
– ESBL-producing Enterobacteriaceae: occurrence, risk factors for fecal carriage and strain traits in the Swiss slaughter cattle population younger than 2 years sampled at abattoir level.
Klebsiella pneumoniae
Klebsiella pneumoniae
La résistance aux céphalosporines de 3ème et 4ème génération a augmenté régulièrement entre 2004 et 2014, mais s’est stabilisé depuis.
Les Klebsiella pneumoniae appartiennent, comme les E. coli, au groupe des Entérobactérales et causent des infections urinaires et, en milieu hospitalier, des infections respiratoires. L’augmentation de la résistance aux céphalosporines de 3ème et 4ème génération a lieu, comme chez les E. coli, de 1% en 2004 à 9.2% en 2014. Les taux de K.pneumoniae résistants aux céphalosporines de troisième et quatrième génération sont néanmoins restés constants au cours des dix dernières années.
Puisqu’il existe un plus grand risque de transmission à l’intérieur des hôpitaux, les patients souffrant de ces infections sont en règle générale isolés.
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Links / Littérature:
Enterobacteriaceae mit Breitspektrum Beta-Laktamasen (ESBL) im Spital: Neue Empfehlungen Swissnoso 2014.
Temporal trends of extended-spectrum cephalosporin resistant Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in Switzerland.
Transmission dynamics of extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae in the tertiary care hospital and the household setting
Neisseria gonorrhoeae
Neisseria gonorrhoeae
Neisseria gonorrhoeae est devenu un microorganisme multirésistant.
Les infections à gonocoques sont en augmentation constante. Elles sont souvent associées à d’autres maladies sexuellement transmissibles comme la chlamydia, le HIV, l’hépatite B ou la syphilis. Les résistances aux céphalosporines orales, aux quinolones et à l’azithromycine augmentent et la ceftrixone reste le seul antibiotique de première ligne. Afin de prévenir le développement de résistances, elle ne devrait être prescrite qu’à des doses plus élevées (-> Guidelines SSI).
Pour surveiller la situation en matière de résistance, il est important de baser le diagnostic du pathogène si possible sur des techniques de culture et pas seulement sur des méthodes de réaction en chaîne par polymérase (PCR). La réalisation de tests de résistance uniquement en cas d’échec du traitement peut conduire à une surestimation des taux de résistance.
Pour activer/désactiver les séries temporelles ou des intervalles de confiance, cliquez sur les cases à cocher. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: 95% Intervalle de confiance de 95%
Tous les isolats qui ont été testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés pour cette analyse. Si plusieurs antibiotiques étaient testés dans la même catégorie, le résultat le plus résistant était pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Le nombre de laboratoires participants évolue avec le temps, ce qui peut également affecter les résultats. Ces données de résistance sont présentées pour la surveillance épidémiologique et ne doivent pas être interprétées comme une recommandation thérapeutique en soi.
Links / Littérature:
Swiss Antibiotic Resistance Report 2022. Textbox Neisseria gonorrhoeae
Chiffres des maladies infectieuses, OFSP
Généralités sur les maladies sexuellement transmissibles: Love-life
Recommandations de la Société suisse d’infectiologie
Pseudomonas aeruginosa
Pseudomonas aeruginosa
La résistance aux antibiotiques augmente lentement chez les P. aeruginosa.
Les Pseudomonas aeruginosa sont déjà intrinsèquement résistants à de nombreux antibiotiques. Ils causent – surtout en milieu hospitalier – des infections pulmonaires, urinaires, vasculaires et peuvent aussi conduire à de graves infections de la peau chez les personnes brûlées. Au cours des dernières années, les taux d’incidence et de résistance ont augmenté régulièrement.
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Salmonella spp.
Salmonella spp.
La salmonellose humaine ne nécessite généralement pas de traitement antimicrobien.
Cependant, chez certains patients, l’infection à Salmonella peut provoquer une maladie grave et une septicémie. Au cours des dernières années, les taux de résistance ont diminué pour les aminopénicillines, mais augmenté pour les fluoroquinolones.
Pour activer/désactiver les séries temporelles ou des intervalles de confiance, cliquez sur les cases à cocher. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Tous les isolats qui ont été testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés pour cette analyse. Si plusieurs antibiotiques étaient testés dans la même catégorie, le résultat le plus résistant était pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Le nombre de laboratoires participants évolue avec le temps, ce qui peut également affecter les résultats. Ces données de résistance sont présentées pour la surveillance épidémiologique et ne doivent pas être interprétées comme une recommandation thérapeutique en soi.
Links / Littérature:
Staphylococcus aureus
Staphylococcus aureus
La résistance à la méticilline chez les S. aureus (MRSA) est en recul.
Les staphylocoques appartiennent, ensemble avec les E. coli, aux germes les plus fréquemment liés à des infections bactériennes chez l’Homme. Ils causent surtout des infections de la peau et des tissus mous, mais aussi des septicémies, des infections ostéo-articulaires et des endocardites.
La résistance à la méticilline –il s’agissait auparavant surtout d’un problème chez les patients hospitalisés – a clairement diminué de 13% en 2004 à 5% en 2021, bien que le taux de S. aureus résistants à la méticilline (MRSA) a légèrement augmenté en ambulatoire. Les MRSA ne sont actuellement plus uniquement un problème hospitalier.
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Links / Littérature:
Staphylococcus aureus and methicillin resistance in Switzerland: regional differences and trends from 2004 to 2014.
Streptococcus pneumoniae
Streptococcus pneumoniae
La résistance à la pénicilline des pneumocoques s’est stabilisée à un faible niveau grâce à la vaccination.
Les pneumocoques causent, comme le nom le suggère déjà, des pneumonies ou des septicémies. La morbidité, ainsi que le taux de résistance ont diminué notamment grâce à la vaccination contre les pneumocoques. Le taux de résistance s’est stabilisé à 4% en 2021.
Choisissez une région souhaitée sur la carte, ou un antibiotique ou une année dans les autres menus. Utilisez les cases à cocher pour activer / désactiver des séries chronologiques individuelles ou des intervalles de confiance. En déplaçant la souris sur un graphique, une barre d’outils s’affiche et permet d’accéder à d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données.
95% CI: Intervalle de confiance de 95%
Pour cette analyse, seuls les isolats invasifs de sang et de liquide céphalorachidien testés contre les (catégories d’) antibiotiques correspondants ont été utilisés. Si plusieurs antibiotiques ont été testés au sein de la même catégorie, le résultat le plus résistant a été pris en compte. Seul le premier isolat par patient, microorganisme et année civile a été inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires. Les isolats sont reliés aux régions par les identifiants des hôpitaux. Comme le calcul du N national prend également en compte les isolats qui ne sont pas attribués à un hôpital couvert par ANRESIS (« NA »), il est possible que le N national soit plus grand que la somme des différentes régions. La procédure d’extrapolation suivante a été utilisée pour calculer les incidences : Chaque hôpital a été classé comme couvert ou non couvert dans la base de données ANRESIS pour chaque année. Sur la base de ces données, un taux de couverture a été calculé pour chaque région linguistique (latine vs germanophone) et chaque type d’hôpital (universitaire vs non universitaire) et chaque année, sur la base des journées de soins spécifiques à l’hôpital. Ces taux de couverture ont ensuite été appliqués aux données de comptage des hôpitaux participant à ANRESIS afin d’obtenir un total national. Les données démographiques proviennent de l’Office fédéral de la statistique. Le nombre de laboratoires participants change au fil du temps, ce qui peut également influencer les statistiques. Les données sur la résistance servent à la surveillance épidémiologique, mais ne peuvent pas être interprétées en soi comme une recommandation de traitement.
Links / Littérature:
La vaccination contre les pneumocoques pour les enfants est recommandée comme vaccination de base, fiche d’information infovac.
Maladies invasives à pneumocoques 2013 – 2017. Bulletin OFSP 03/2019, p. 10-19.
Centre national pour les pneumocoques invasifs:
Serotype/serogroup-specific antibiotic non-susceptibility of invasive and non-invasive Streptococcus pneumoniae, Switzerland, 2004 to 2014.
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ANRESIS-guide
Représentation interactive des données de résistance les plus récentes. Contient les recommandations de traitement et s’adresse plus particulièrement aux professionnels de la santé.
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Représentation en tableau des données de résistance les plus importantes en Suisse.
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Entérobactéries résistantes aux carbapénèmes
Bien que le nombre d’Entérobactéries résistantes aux carbapénèmes soit relativement faible, il a augmenté en continu ces dernières années.
Entérobactéries résistantes aux carbapénèmes (CRE)
Les carbapénèmes sont des antibiotiques à large spectre indiqués pour des infections sévères causées notamment par des germes multi-résistants, par exemple les entérobactéries productrices de bétâ-lactamases à spectre étendu. Un suivi de la résistance à cette classe d’antibiotiques à épargner est indispensable. ANRESIS analyse la résistance aux carbapénèmes chez les entérobactéries en continu et publie ces données sur le site internet.
La non-susceptibilité aux carbapénèmes peut être causée par différents mécanismes, comme la diminution de perméabilité, les pompes à efflux ou par la production de carbapénémases. Le mécanisme de résistance ne peut pas être seulement prédit par un test de résistance. Á cause de leur multirésistance et leur dissémination rapide, une attention particulière est donnée pour les entérobactéries productrices de carbapénémases (voir prochaine section).
Évolution temporelle des CRE en Suisse
Choisissez la région souhaitée ou un microorganisme dans le menu déroulant. Pour activer/désactiver un type d’échantillon, cliquez sur les cases à cocher. Lorsque vous déplacez la souris sur le diagramme, une barre d’outils s’affiche, qui permet d’autres fonctions telles que le zoom ou l’étiquetage des données. Vous trouvez ici une carte des différentes régions d’ANRESIS.
Les CRE sont définis comme résistant à l’imipénème et/ou au méropénème. Pour Morganellaceae (Morganella spp., Proteus spp. et Providencia spp.) seul le plein résistance contre méropénème était considéré. Seul le premier isolat par patient, micro-organisme et année civile a été inclus. Le nombre d’isolates peut aussi être influencé par le nombre des laboratoires inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires.
CRE : Distribution de micro-organismes
Choisissez une région ou une année souhaitée dans le menu déroulant. Déplacez la souris sur le diagramme pour afficher les données en détail. Vous trouvez ici une carte des différentes régions d’ANRESIS.
Les CRE sont définis comme résistant à l’imipénème et/ou au méropénème. Pour Morganellaceae (Morganella spp., Proteus spp. et Providencia spp.) seul le plein résistance contre méropénème était considéré. Seul le premier isolat par patient, micro-organisme et année civile a été inclus. Le nombre d’isolates peut aussi être influencé par le nombre des laboratoires inclus. Les résultats sont rapportés tels que fournis par les laboratoires.
Entérobactéries productrices de carbapénémases (CPE)
Les entérobactéries qui produisent des carbapénémases (appelées les entérobactéries productrices de carbapénémases ou EPC) sont particulièrement résistantes à un grand nombre de classes d’antibiotiques autres que les carbapénèmes. Á cause de cette multirésistance et dû à leur dissémination rapide, ils représentent une menace particulière. La déclaration des EPC a donc été rendue obligatoire par le gouvernement suisse à partir de 2017 et depuis janvier 2019, tous les isolats d’EPC doivent être envoyés au Centre national pour la détection précoce et la surveillance des résistances émergentes aux antibiotiques (NARA) pour une analyse détaillée des mécanismes de résistance et pour la détection précoce de flambées. Une aperçu de las sitaution actuelle a été publié dans lEUROSURVEILLANCE 2021.
Les EPC sont classifiés d’après les similitudes de leur séquence d’acide aminé de leurs carbapénémases. Les génotypes les plus courants en Suisse sont actuellement les OXA-48 et les NDM.
CPE : Espèces et génotypes
Sélectionnez une région et une année dans le champ de sélection.
CPE: Entérobactéries productrices de carbapénémases
IMP: Imipenemase
KPC: K. pneumoniae carbapenemase
NDM: New Delhi metallo-β-lactamase
OXA-48: Oxacillinase 48
OXA-other: Oxacillinase 181 (OXA-181), Oxacillinase 232 (OXA-232) et Oxacillinase 244 (OXA-244)
VIM: Verona integron–encoded metallo-β-lactamase
De 2013 à 2015, des isolats CPE potentiels ont été caractérisés par des laboratoires experts nommés par le Comité suisse des antibiogrammes (SAC) de la Société suisse de microbiologie. Les données ont été collectées par le SAC. Depuis 2016, tous les isolats CPE doivent être déclarés à l’Office fédéral de la santé publique (OFSP). Il recueille également des données épidémiologiques. Depuis 2019, il est obligatoire d’envoyer les isolats CPE potentiels au laboratoire national de référence (NARA), qui effectue le génotypage et stocke les isolats.
La déduplication a été réalisée au niveau de l’espèce et du génotype. Seul l’isolat apparu pour la première fois au cours d’une année civile a été pris en compte chez le même patient.
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